Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRAMP1Q96RY5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms