Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms