Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms