Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBE2E2Q96LR5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBE2E2Q96LR5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms