Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDLIM2Q96JY6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDLIM2Q96JY6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms