Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG3Q96JB2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG3Q96JB2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms