Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF496Q96IT1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF496Q96IT1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms