Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNFT2Q96EX2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms