Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP4Q969X6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms