Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKL1Q969V6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms