Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX21Q969T3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms