Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms