Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP13Q92995 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP13Q92995 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms