Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRG4Q92954 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRG4Q92954 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms