Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF4BQ92750 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms