Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBXN4Q92575 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBXN4Q92575 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBXN4Q92575 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBXN4Q92575 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBXN4Q92575 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBXN4Q92575 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBXN4Q92575 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBXN4Q92575 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBXN4Q92575 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBXN4Q92575 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBXN4Q92575 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBXN4Q92575 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms