Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms