Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms