Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
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