Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms