Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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DTX3Q8N9I9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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DTX3Q8N9I9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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DTX3Q8N9I9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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DTX3Q8N9I9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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DTX3Q8N9I9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DTX3Q8N9I9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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