Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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FAM71E2Q8N5Q1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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FAM71E2Q8N5Q1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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FAM71E2Q8N5Q1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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FAM71E2Q8N5Q1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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FAM71E2Q8N5Q1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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FAM71E2Q8N5Q1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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FAM71E2Q8N5Q1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FAM71E2Q8N5Q1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FAM71E2Q8N5Q1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM71E2Q8N5Q1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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