Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME8Q8N427 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME8Q8N427 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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