Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLX4Q8IY92 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX4Q8IY92 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms