Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms