Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC83Q8IWF9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms