Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC71Q8IV32 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms