Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNL1Q8IU54 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms