Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms