Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms