Protein–RNA interactions for Protein: Q86UX7

FERMT3, Fermitin family homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT3Q86UX7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FERMT3Q86UX7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms