Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms