Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms