Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms