Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHST3Q7LGC8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST3Q7LGC8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms