Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms