Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM5Q71RC9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms