Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR88Q6ZMY6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR88Q6ZMY6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms