Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL4Q6XD76 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms