Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L3Q6VB84 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms