Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
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