Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA3EQ6PEY2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms