Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC62Q6P9F0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC62Q6P9F0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC62Q6P9F0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC62Q6P9F0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC62Q6P9F0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC62Q6P9F0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC62Q6P9F0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC62Q6P9F0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC62Q6P9F0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC62Q6P9F0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC62Q6P9F0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC62Q6P9F0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms