Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6P435 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6P435 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6P435 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6P435 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6P435 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6P435 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6P435 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6P435 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q6P435 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q6P435 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q6P435 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q6P435 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6P435 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms