Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms