Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms