Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC144NLQ6NUI1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms