Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms