Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPPQ6IPU0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms