Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms